Solarpunk computational biology laboratory — original artwork
Yalbi I. Balderas-Martínez

Yalbi I. Balderas-Martínez

Investigadora en Ciencias Médicas

Medical Sciences Researcher

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER)

En el Laboratorio de Biología Computacional del INER realizamos investigación en bioinformática y biología de sistemas para entender las enfermedades respiratorias, particularmente la fibrosis pulmonar idiopática. Combinamos análisis de expresión génica, redes regulatorias y ciencia de datos para avanzar en la medicina traslacional.

At INER's Computational Biology Laboratory we conduct research in bioinformatics and systems biology to understand respiratory diseases, particularly idiopathic pulmonary fibrosis. We combine gene expression analysis, regulatory networks, and data science to advance translational medicine.

bioinformatics pulmonary fibrosis transcriptomics systems biology R / Bioconductor gene regulation

Líneas de investigación Research Lines

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Fibrosis pulmonar idiopática

Idiopathic Pulmonary Fibrosis

Análisis transcriptómico de fibroblastos pulmonares bajo hipoxia y normoxia. Identificación de genes y redes regulatorias implicadas en la progresión de la IPF, incluyendo lncRNAs, miRNAs y factores de transcripción.

Transcriptomic analysis of lung fibroblasts under hypoxia and normoxia. Identification of genes and regulatory networks involved in IPF progression, including lncRNAs, miRNAs, and transcription factors.

🧬

Redes regulatorias y biología de sistemas

Regulatory Networks & Systems Biology

Modelado de redes de regulación génica en contextos de enfermedad. Desde redes transcripcionales en bacterias (RegulonDB) hasta redes inmunológicas en COVID-19 y atractores cíclicos en diferenciación de macrófagos.

Modeling gene regulatory networks in disease contexts. From transcriptional networks in bacteria (RegulonDB) to immunological networks in COVID-19 and cyclic attractors in macrophage differentiation.

💻

Bioinformática y bases de datos

Bioinformatics & Databases

Desarrollo de herramientas computacionales para enfermedades respiratorias, incluyendo PulmonDB (base de datos de expresión génica pulmonar) y pipelines de análisis para microarreglos, RNA-seq y metilación.

Development of computational tools for respiratory diseases, including PulmonDB (lung gene expression database) and analysis pipelines for microarrays, RNA-seq, and methylation.

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Enfermedades respiratorias emergentes

Emerging Respiratory Diseases

Respuesta inmunológica y transcriptómica frente a COVID-19 e influenza. Identificación de regulones, factores clínicos diferenciales y redes de células T CD4+ en enfermedad severa.

Immunological and transcriptomic response to COVID-19 and influenza. Identification of regulons, differential clinical factors, and CD4+ T cell networks in severe disease.

🧫

Organoides alveolares

Alveolar Organoids

Desarrollo de organoides alveolares en ratón como modelos tridimensionales para el estudio de enfermedades pulmonares.

Development of mouse alveolar organoids as three-dimensional models for studying lung diseases.

🛡️

Células Natural Killer y envejecimiento

Natural Killer Cells & Aging

Estudio del papel de las células Natural Killer en el contexto del envejecimiento y su relación con la respuesta inmune innata.

Study of Natural Killer cell function in the context of aging and its relationship with the innate immune response.

Publicaciones Publications

23 artículos en revistas indexadas y capítulos de libro. 23 articles in indexed journals and book chapters. Google Scholar →

Contacto Contact

Ubicación

Location

Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas
Calzada de Tlalpan 4502, CDMX, México

National Institute of Respiratory Diseases Ismael Cosío Villegas
Calzada de Tlalpan 4502, Mexico City, Mexico

Formación académica Education

Doctorado en Ciencias Ph.D. in Sciences

UNAM — Centro de Ciencias Genómicas, 2014

Licenciatura en Biología B.S. in Biology

Universidad Veracruzana, 2007